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以天然产物结构为先导一直是寻找新型生物活性分子的有效策略。本文选择天然γ-内酰胺和二芳基乙烯结构为母核,通过活性叠加及药效团杂环等分子设计原理,引入具有广泛生物活性的胡椒基药效团,并在此结构基础上进行结构衍生及先导优化。
摘要：HIV-1非核苷类逆转录酶抑制剂(NNRTIs)作为临床抗艾滋病疗法中重要的组成部分,在艾滋病的防治过程中发挥着必不可少的作用.然而,随着用药时间的加长,HIV-1病毒会逐渐产生耐药性,加上药物长期服用引起的毒副作用,大大降低了病人的临床顺应性,限制了该类药物的临床应用,因此开发活性更高...
记录一下完整的pharmacophore的过程初始文件复合物晶体结构->PLIF->药效团序列加载蛋白复合物以及初始设置准备1.读取蛋白文件2.修改背景颜色为白色,修改立场文件3.删除多余链与配体4.调整蛋白结构显示5.蛋白分子的预处理叠合蛋白-配体复合...
第10期董光等：整合药效团的分子对接方法研究1791．2基于药效团的计算机药物虚拟筛选tolerance。.本算法以任取4特征点结构为例。.对同一特征点集基于药效团的药物虚拟筛选是药物筛选技术发展的另一个中任意特征点，选取其他3个点共同构成该特征点的...
本研究构建了基于受体的药效团模型，其包括在STAT3同二聚体内的两个STAT3单体的SH2结构域之间建立的关键相互作用，用于筛选商业化合物数据库。然后采用不同的对接方法将过滤的配体进行对接分析和MD模拟研究，选择4个候选物进…
图1.基于结构的药效团识别二.实例描述以CDK2激酶与抑制剂复合物结构1KE6为例，说明基于结构的药效团识别过程。下载蛋白结构在屏幕右上角键…
药效团模型搜索（CompoundProfiling）:DiscoveryStudio为研究者提供基于受体或基于受体-配体相互作用构建代表受体活性口袋化学和几何信息的药效团模型的算法[2]一个分子与多个代表各靶标蛋白的药效团模型相互匹配，按照打分高低来判定可能与哪个靶标相互作用...
全新药物设计基于靶点结构的三维结构搜寻模板定位法原子生长法分子碎片法...化合物进行3D-QSAR研究系列活性化合物进行3D-QSAR研究，并结合构象分析，得出该类药物的药效基团模型可在受体三维结构未知的情况下团模型。可在...
此时便得到了一个含有排除体积的基于蛋白结构的药效团模型。.以上就是利刃君为大家带来的利用DiscoveryStudio2016软件进行基于受体结构药效团模型的构建教程啦~.更多DiscoveryStudio软件使用教程，进入“叮当学术”公众号首页，点击下方菜…
基于药效团进行数据库搜索的工具，可以帮助科研人员查找到可能的先导化合物。这些可检索的药效团中包含了结合特征、形状以及特性约束等信息，将这样的药效团作为一个数据库的检索条件，在包含了成千上万个分子结构的商业或内部数据库中进行查询。